如何選定qPCR實驗用純水儀?
目前疫情的防控工作取得了階段性的成效,基于實時熒光定量PCR的核酸檢測技術在新冠病毒快速鑒定及確診中發揮了重要作用。
什么是實時熒光定量PCR?
實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技術,簡稱qPCR,是在PCR反應體系中加入熒光物質(熒光染料或熒光標記的特異性探針),利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。
與普通PCR相比,實時熒光定量PCR技術是一次由定性技術向定量技術的飛躍。運用該項技術,可以對DNA、RNA樣品進行相對定量、絕對定量和定性分析。
實驗流程:
在實時熒光定量PCR實驗中,可以分為樣本采集,RNA提取,RNA質量鑒定,反轉錄及數據分析幾個步驟,在進行引物、模板的稀釋,試劑的配制和補足反應體系時都會用到水,水質量的好壞直接影響最終數據分析的結果。
水中的顆粒物,離子含量,有機物及細菌微生物等雜質對實驗都會帶來影響,最值得關注的因素有以下兩個方面:
1. DNA酶和RNA酶
DNA酶和RNA酶能夠特異性地降解DNA和RNA。在進行實時熒光定量PCR時,去除這兩種酶從而保證提取的RNA和DNA樣本的完整性十分關鍵。尤其在提取RNA的時候,RNA極易被降解。這是因為RNase非常穩定,且無處不在,用常規的高溫高壓蒸汽方法和蛋白酶抑制劑不能使所有的RNase完全失活。如果樣本中的核酸被降解,會影響檢測結果的準確性,甚至造成假陰性檢測結果。
因此,實時熒光定量PCR實驗用超純水必須有效降低DNA酶和RNA酶的含量,減少對實驗的影響。
2. 鎂離子
實時熒光定量PCR實驗需要根據不同的引物對和模板確定最佳的鎂離子濃度。
Mg2+濃度過低,會影響DNA聚合酶的活性,導致產量降低,影響實時定量的敏感性;
Mg2+濃度過高,會增加引物二聚體的形成,這會影響特異性。
因此,實時熒光定量PCR實驗用超純水必須控制Mg2+濃度,避免背景因素帶來的不確定性。
綜上,實時熒光定量PCR實驗推薦使用超純水,水質要求如下圖所示:
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